الأهداف الاستراتيجية للجامعة:

تسعي جامعة الفنار الى تحقيق التميز في كافة برامجها التعليمية وأنشطتها البحثية وخدماتها المجتمعية، وأن تكون المؤسسة الجامعية الأكثر تميزا ( القائدة / الرائدة ) على مستوى العالم العربي في المجالات التي ترتبط بخصوصية دورها كمؤسسة منتجة للمعرفة، والتفرد في اختيار موقعها الجغرافي والإقليم الاقتصادي الذي توجد فيه والذي يمثل منفذا كبيرا للصناعة والمحتضن لنسبة كبيرة من المنشات الصناعية في مصر، والمتصل بظهير صحراوي واعد تنمويا يتمثل في الصحراء والوادي، وتسعي الجامعة الي التميز بعدة قيم ومبادئ اهمهها الانفتاح على ثقافات الغير والتسامح وقبول الآخر والاستعداد للحوار البناء وتبادل الأفكار.

وفي ضوء ذلك تتمثل الاهداف التشغيلية لجامعة الفنار في الاتى:

1-الالتزام بتطبيق معايير الجودة وتقييم القدرة المؤسسية والفاعلية التعليمية دورياً.
2- المساهمة في التنمية الاجتماعية والبشرية والمؤسسية , وأن تسهم في استمرارية التنمية والتجديد الحضري لإقليمها, وأن تتضافر برامجها وأنشطتها المعرفية والثقافية مع أدوار وأنشطة مؤسسات المعرفة الأخرى التي تقع في إقليمها ودوائرها الحيوية .
3- تسعى جامعة الفنار الي ان تصبح كيان معرفي متميز ينمى روابطه على نطاق مصر والعالم العربي وأفريقيا والعالم بشكل عام.
4- تسعي الجامعة الي تحقيق الكفاءة في الأداء المؤسسي لتحسين الوضع التنافسي للجامعة.
5- الإجاده والتميز فى جميع المجالات بتحقيق تقدم فى التصنيفات العالميه والإقليميه والمحليه .
6- إعداد وتصميم نماذج التقييم بكافة صورها وتحليلها واستخراج النتائج والمؤشرات .
7- إعداد مقترحات خطط التحسين والتطوير بالكلية .
8- متابعة تنفيذ الخطة التنفيذية للخطة الاستراتيجية .
9-   متابعة توصيفات وتقارير البرامج والمقررات وكذلك متابعة الأداء بتلك البرامج.
10-   عقد ندوات التوعية الخاصة لنشر ثقافة الجودة على كافة أطراف الكلية.
11-   إعداد التقارير السنوية والدراسة الذاتية للكلية .
12-   نشر الوعى بضرورات حماية الملكية الفكرية وتحقيق المصداقية .
13- متابعة تطوير وتحسين البنية التحتية للكلية .
15- تقويم مؤسسي و إدارة جودة متطورة و فعالة.
14- متابعة الخريجين وسبل التواصل معهم.